Линкълн Бъроуз е осъден на смърт, но брат му Майкъл Скофийлд не вярва, че той е виновен. С наближаването на екзекуцията Майкъл предприема драстични мерки и влиза в затвора “Фокс Ривър”.

Оказва се, че като строителен инженер Скофийлд има чертежите на затвора и сложен план, с който да измъкне Линкълн оттам. С влизането си във “Фокс Ривър”, Майкъл започва да вербува различни хора, които съзнателно или несъзнателно ще му помогнат да осъществи плана си.

Извън стените на затвора Вероника, бивша приятелка на Линкълн и настоящ негов адвокат, се опитва да разгадае мистерията около очевидно изфабрикуваното обвинение. Оказва се, че са намесени хора от най-висшите кръгове на държавното управление. Ясно е, че истината ще навреди на много важни личности, което прави разкриването й доста опасно и рисковано начинание.